生物医学 AI Agent 技能集合（1676个）¶

一句话概述：Awesome Bio Agent Skills 是一个精心整理的生物医学研究 AI Agent 技能集合，涵盖基因组学、蛋白质组学、单细胞分析、临床 AI 以及蛋白质设计等领域。

核心功能与知识点详解¶

项目核心目标¶

• 资源整合：汇总生物医学研究中可复用的 AI Agent 技能，避免重复造轮子。
• 标准化格式：每个技能以独立文件夹形式存在，内含 SKILL.md 文件，遵循统一的模板，便于 Agent 框架加载与调用。
• 跨领域覆盖：涵盖基因组、蛋白质组、单细胞、临床医学、蛋白质设计等关键方向。

数据来源¶

技能来自 20 个公开仓库，包括但不限于：

• bioskills
• 其他未列明的仓库（sources 模块会显示完整列表）

技能分类（15 类）¶

1. Genomics（基因组学）— 526 个技能
2. Proteomics（蛋白质组学）
3. Single-Cell Analysis（单细胞分析）
4. Biology and AI（生物学与 AI）
5. Clinical and Medical（临床与医学）
6. Transcriptomics（转录组学）
7. Database Query（数据库查询）
8. Multi-Omics Integration（多组学整合）
9. Bioinformatics Utilities（生物信息学工具）
10. Visualization（可视化）
11. Workflow Orchestration（工作流编排）
12. Epigenomics（表观基因组学）
13. Pathway Analysis（通路分析）
14. Metagenomics（宏基因组学）
15. Protein Design（蛋白质设计）

技能格式¶

每个技能文件夹中包含：

• SKILL.md：技能描述、输入输出、依赖、使用方法、示例等。
• 可选的其他文件（如配置文件、测试数据）。

技能示例（Genomics 分类的部分技能列表）：

（以上表格仅展示 Genomics 类别的部分技能，完整列表请查阅项目仓库 bioskill_index_v3.csv 文件。）

使用方式¶

此集合设计为 Agent 框架的“技能库”。你可以：

1. 克隆仓库到本地：

   git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills.git
   

2. 将 skills 目录下的子文件夹（即每个技能）拷贝到 Agent 框架（如 OpenClaw、NanoClaw、Biomni）的技能目录中。
3. Agent 会自动识别 SKILL.md 文件并根据描述调用对应工具。

如何贡献¶

• 欢迎提交新的技能文件夹（遵循 SKILL.md 模板）。
• 欢迎报告缺失或错误技能。
• 请参考仓库中的 CONTRIBUTING.md（如果存在）。

常见问题¶

Q1：技能是否都是独立的？ 是的，每个技能是一个自包含的文件夹，包含所需的描述和代码。

Q2：技能基于哪些 Agent 框架？ 兼容 Claude 基础 Agent 框架，显式支持 OpenClaw、NanoClaw、Biomni。其他框架可能也适用，但未正式测试。

Q3：技能数量是否准确？ 集合包含 1676 个去重后的技能，索引文件为 bioskill_index_v3.csv。

Q4：这些技能可以直接在本地运行吗？ 每个技能内部可能包含 Python 脚本或 Shell 命令，但需依赖外部工具（如 samtools、Biopython 等）。请阅读相应 SKILL.md 中的依赖说明。

Q5：20 个来源仓库是哪些？ 请查看项目仓库中的 Sources 模块（部分：## Sources）。

速查表¶

注意：以上数量除 Genomics 外均未在原文中给出，请以项目 bioskill_index_v3.csv 为准。

许可证¶

本项目采用 CC0 1.0 Universal 协议，属于公共领域（Public Domain）。