Zotero 文献管理¶

一句话概述：Zotero 是免费开源的文献管理工具，一键保存论文、自动生成参考文献、管理 PDF，是做科研必备工具。

核心知识点¶

概念	白话解释
Zotero	文献管理器 = 论文的图书馆管理员
Connector	浏览器插件 = 一键从网页抓论文信息
Collection	文献集 = 按项目/主题分类的文件夹
Item	条目 = 一篇论文的所有信息（标题、作者、DOI 等）
Citation Style	引文样式 = 控制参考文献的显示格式（APA/Nature 等）
Sync	同步 = 多设备间同步文献库

安装配置¶

# 下载安装
# 1. 官网 https://www.zotero.org 下载 Zotero 7（2024年起为最新主版本）
# 2. 安装浏览器 Connector 插件（Chrome/Firefox/Edge/Safari）

# Linux 安装
# 下载 tarball 后解压
tar -xf Zotero-7*.tar.bz2                             # 解压
sudo ln -s /opt/zotero/zotero /usr/local/bin/zotero    # 创建快捷方式

基本使用¶

使用流程：
1. 在浏览器打开论文页面（PubMed/Google Scholar/期刊网站）
2. 点击 Connector 图标 → 自动保存论文信息 + PDF
3. 在 Zotero 中整理到对应 Collection
4. 写论文时插入引文 → 自动生成参考文献列表

文献集组织建议：
📁 我的文献库
├── 📂 毕业论文
│   ├── 📂 T2D 肠道菌群
│   ├── 📂 宏基因组方法
│   └── 📂 机器学习
├── 📂 面试准备
└── 📂 待读论文

必装插件¶

# 安装方式：Zotero → 工具 → 插件 → 齿轮图标 → Install from file

1. Zotero PDF Translate（翻译插件）
   - 选中 PDF 文字自动翻译
   - 支持 DeepL/Google/百度翻译
   - 地址：https://github.com/windingwind/zotero-pdf-translate

2. Better BibTeX（引文管理增强）
   - 自动生成 citation key（如 wang2022gut）
   - 自动导出 .bib 文件给 LaTeX/Typst 用
   - 地址：https://retorque.re/zotero-better-bibtex/

3. Zotero GPT / Aria（AI 助手）
   - AI 辅助阅读和总结论文
   - 地址：搜索 Zotero 插件市场

4. ZotFile（文件管理，Zotero 6 用，7 已内置）
   - 自动重命名 PDF（作者_年份_标题.pdf）
   - 管理 PDF 附件存储位置

与写作工具集成¶

# Word/LibreOffice 集成
# 安装 Zotero 时自动安装 Word 插件
# Word 中：Zotero 标签页 → Add Citation → 搜索文献 → 插入
# 写完后：Add Bibliography → 自动生成参考文献列表

# LaTeX 集成（通过 Better BibTeX）
# Zotero → 文件 → 导出文献库 → Better BibTeX → 保持更新
# 导出的 .bib 文件可直接在 LaTeX 中 \bibliography{refs}

# Markdown 集成
# 使用 Pandoc + citeproc：
# pandoc paper.md --citeproc --bibliography=refs.bib -o paper.pdf
# Markdown 中引用：[@wang2022]

常见报错¶

报错	原因	解决
Connector 点击无反应	插件未启用或页面不支持	刷新页面，检查 Connector 是否启用
PDF 下载失败	没有期刊权限	配置代理或从校园网下载
同步冲突	多设备同时修改	解决冲突后重新同步
Word 插件消失	更新后丢失	Zotero → 编辑 → 首选项 → 引用 → 文字处理软件 → 重新安装
引文样式不对	CSL 文件不对	在首选项中更换引文样式

速查表¶

# 快捷操作
# Ctrl+Shift+S → 保存网页快照
# 浏览器 Connector 图标 → 一键保存论文
# 拖拽 PDF 到 Zotero → 自动识别元数据

# 文献管理
# 右键 → 创建子集 → 分类管理
# 右键 → 从 DOI/ISBN 添加 → 手动添加
# 标签系统 → 给文献打标签（已读/重要/方法类）

# 导出格式
# Better BibTeX (.bib) → LaTeX/Typst
# CSL JSON (.json) → Pandoc
# RIS (.ris) → 通用格式
# 复制引用 → 直接粘贴到文档

# 推荐工作流
# 1. 浏览器看论文 → Connector 一键保存
# 2. Zotero 中分类整理 + 打标签
# 3. PDF 阅读 + 翻译 + 做笔记
# 4. 写论文时插入引文 → 自动生成参考文献